把深时的事件链，做成可讲、可查、可演示的视觉系统
页面主题聚焦P–T危机窗口及其后续复苏：用曲线、相图、地层柱状图与形态空间，讲清楚“何时发生、为何发生、如何崩塌、怎样复苏”。 放射虫作为硅质浮游生物，其形态与地层记录都适合和深度学习结合：从显微图像到可解释特征与 embedding，再对齐到剖面与代理指标。
时间轴
259–237 Ma（晚二叠—中三叠）：危机脉冲与复苏台阶，强调窗口与迟滞。
环境代理
δ13C、缺氧/还原态扩张、温室强度与酸化压力，用于构建机制组合。
放射虫
形态参数化与 morphospace：危机期收缩，复苏期扩张与新簇出现。
深度学习
分割→分类→embedding→剖面对齐：可解释特征库与不确定性，让输出可用。
关于这个可视化
这套页面是 Yaxuan Shen (Scott) 对 P–T 大灭绝研究的一个可交互、可复现的展示窗口。每个图表都可调整参数，每次调整都有数据支撑，每个数字都能溯源。
当前研究
P–T 危机窗口（252 Ma）期间放射虫形态多样性的收缩与复苏轨迹，结合 δ13C、缺氧、温室强度等代理指标反推机制组合。
怎么读这一页
先看 Timeline 锚定时间，再进 P–T 仪表盘 看机制，再用 放射虫 Atlas 看形态响应；StratLab 把事件落到剖面，DeepLearning Lab 给出方法学。
交互说明
图表可拖拽 / 滚轮缩放 / 滑块调参；按 / 全局索引；J/K 翻阶段；G/L 跳 P–T 或 DL 区。所有图均离线生成，无外部 API 依赖。
Ⅰ.a 地质时间轴
从太古宙到新生代：拖拽浏览，点击聚焦，P-T 界线危机带突出显示。
Ⅰ. P–T 危机仪表盘
阶段—信号—机制：把“危机窗口”展开成过程，把“多因素”组织成组合，把“崩塌与复苏”画成可讨论的曲线。
Ⅰ.b 机制与代理图谱
把“机制”拆成可画的变量：碳循环（δ13C）、氧化还原（缺氧/还原态扩张）、温度与酸化压力，并把它们放到同一个可视化语法里。
一条可讲的“事件链”
（1）大型火成岩省/热液系统提高温室气体输入 →（2）增暖增强海洋分层、降低通气效率 →（3）缺氧与硫循环改变生境边界 →（4）碳循环异常（δ13C）记录系统扰动 →（5）生态网络跨越阈值，出现崩塌与迟滞复苏。
Ⅰ.c 化石产地地图
全球 P-T 界线化石剖面分布：悬停标记查看详情，切换阶段查看不同时期的关键产地。
Ⅱ. 放射虫演化 Atlas
形态=参数向量：棘刺、孔洞、壳层、对称性、房室结构。危机与复苏改变的不仅是“数量”，还有形态空间的占据方式。
| Feature | 含义 | 典型用途 |
|---|
Ⅱ.b 放射虫形态对比
并排比较两个类群的形态参数：选择不同类群，调节复杂度与孔洞密度，观察形态差异。
Ⅲ. 地层实验室（StratLab）
把事件锚定在剖面：层位-厚度-岩性 + 标志层。你可以编辑层位，实时重绘柱状图与随深度代理曲线。
| Bed | 厚度 (cm) | 岩性 | 注释 |
|---|
Ⅳ. 深度学习实验室（DeepLearningLab）
显微图像 → 分割 → 分类 → embedding → 剖面对齐。这里把“怎么做”讲清楚：指标、校准、域偏移、误差归因与原型样本库。
Ⅴ. References（精选）
作为阅读入口：用于演讲/写作时的文献锚点。正式引用请核对原文与出版信息。
- Erwin, D. H. (1994). The Permo–Triassic extinction. Nature 367, 231–236.
- Payne, J. L., & Clapham, M. E. (2012). End-Permian mass extinction in the oceans: an ancient analog for the twenty-first century? Annual Review of Earth and Planetary Sciences 40, 89–111.
- Benton, M. J., & Twitchett, R. J. (2003). How to kill (almost) all life: the end-Permian extinction event. Trends in Ecology & Evolution 18, 358–365.
- Wignall, P. B., & Twitchett, R. J. (1996). Oceanic anoxia and the end Permian mass extinction. Science 272, 1155–1158.
- Burgess, S. D., Bowring, S. A., & Shen, S.-Z. (2014). High-precision timeline for Earth's most severe extinction. PNAS 111, 3316–3321.
- Shen, S.-Z. et al. (2011). Calibrating the end-Permian mass extinction. Science 334, 1367–1372.
- Burgess, S. D. et al. (2017). Initial pulse of Siberian Traps sills as the trigger of the end-Permian mass extinction. Nature Communications 8, 164.
- Joachimski, M. M. et al. (2020). Five million years of high atmospheric CO₂ in the aftermath of the Permian-Triassic mass extinction. Geology 48, 690–694.
- Penn, J. L. et al. (2018). Temperature-dependent hypoxia explains biogeography and severity of end-Permian marine mass extinction. Science 362, eaat1327.
- Clarkson, M. O. et al. (2015). Ocean acidification and the Permo-Triassic mass extinction. Science 348, 229–232.
- Chen, Z.-Q., & Benton, M. J. (2012). The timing and pattern of biotic recovery following the end-Permian mass extinction. Nature Geoscience 5, 375–383.
- Song, H. et al. (2020). An integrated assessment of the temporal and spatial evolution of the Permian-Triassic mass extinction. Earth-Science Reviews 208, 103260.